Die Erzeugung von Strom aus Wasserkraft spielt aufgrund der Topographie im Bodenseekreis eine eher untergeordnete Rolle. Derzeit werden ca. 21 Wasserkraftanlagen von 5 bis 80 kW Leistung betrieben. Diese Anlagen haben im Jahr 2010 insgesamt ca. 1,7 Mio. kWh in das Netz eingespeist.

Mit der Nutzung sind ökologische Beeinträchtigungen verbunden. Um diese zu vermindern werden an den Wehranlagen Rampen oder Umgehungsgerinne gebaut. Sie machen es Fischen und Kleinlebewesen möglich, diese Anlagen zu passieren. Im Bodenseekreis wird auf die Wanderung der Seeforelle ein besonderes Augenmerk gelegt. Sie steigt aus dem Bodensee in die Gewässer auf und laicht in den strukturreichen Abschnitten der Oberläufe der Gewässer.

Die vorhandenen Nutzungen und die Potenziale wurden in der Studie "Potenziale der Wasserraftnutzung im Bodensee" zusammengefasst.

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